Ve väčšine prípadov si môžeme vybrať medzi 3 typmi vnútorných filtrov:
1) Klasický vnútorný filter s filtračnou penou + v niektorých typoch menšie množstvo sypkých filtračných materiálov, napríklad Eheim Pick-up, Aquaball, Biopower alebo rôzne variácie dokonalých AquaEl filtrov. Vhodné na použitie od približne 40 l do 200 l.
2) Čohlava čerpadla + molitan, výhodou je väčší filtračný objem, nevýhodou pre niekoho môže byť v konštrukcii a zaberá viac miesta v akváriu, vhodné použitie od 50l do cca 500l.
3) Bsublifuge, malá upravená špongia, do ktorej sa prostredníctvom vzduchového motora vháňa vzduch, čím sa vytvorí prúdenie vody cez filtračnú špongiu, používa sa pre malé akváriá do cca 50l, vhodné napríklad pre krevety.